После того, как вы загрузили выписки из клиент-банка, необходимо проверить платежные поручения, которые были созданы автоматически на основе выписок.
- В разделе «Учет/Деньги/Банк» на вкладке «Платежи» в фильтре
установите период, за который были загружены выписки. На панели быстро фильтра убедитесь, что выбран параметр «Приход и расход» по всем операциям. 
- Проверьте, соответствует ли операция назначению платежа. В случае необходимости измените регламент:
Проверьте, что платежное поручение связано с выпиской из банка и со счетом.
- Если у вас не настроено автоматическое проведение платежей при загрузке, проведите платежные документы.