Перед тем как закрывать месяц и формировать проводки, зафиксируйте расчеты отдельно по каждому сотруднику или подразделению.
В разделе «Сотрудники/Зарплата» на вкладке в строке нужного сотрудника или подразделения нажмите 
, чтобы зафиксировать расчет — в этом случае проводки не будут сформированы.
Зарплата фиксируется сразу за все месяцы до того, в котором нажата галка. Поэтому если необходимо зафиксировать заплату за период, достаточно закрыть сотрудника в последнем месяце этого периода.